MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides fragilis NCTC 9343 plasmid pBF9343

Total Repeats: 752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006873	ATA	2	6	135	140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650142
2	NC_006873	AAG	2	6	199	204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650142
3	NC_006873	TAGA	2	8	316	323	50 %	25 %	25 %	0 %	60650142
4	NC_006873	TA	3	6	351	356	50 %	50 %	0 %	0 %	60650142
5	NC_006873	AGAAA	2	10	370	379	80 %	0 %	20 %	0 %	60650142
6	NC_006873	ATA	2	6	480	485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650142
7	NC_006873	GAAC	2	8	489	496	50 %	0 %	25 %	25 %	60650142
8	NC_006873	GAC	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650142
9	NC_006873	AGC	2	6	584	589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650142
10	NC_006873	ATT	2	6	613	618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650142
11	NC_006873	TGA	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650142
12	NC_006873	AGA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650142
13	NC_006873	AATA	2	8	714	721	75 %	25 %	0 %	0 %	60650142
14	NC_006873	A	6	6	1199	1204	100 %	0 %	0 %	0 %	60650143
15	NC_006873	GTG	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60650143
16	NC_006873	T	6	6	1314	1319	0 %	100 %	0 %	0 %	60650143
17	NC_006873	T	6	6	1326	1331	0 %	100 %	0 %	0 %	60650143
18	NC_006873	T	7	7	1361	1367	0 %	100 %	0 %	0 %	60650143
19	NC_006873	TCAA	2	8	1373	1380	50 %	25 %	0 %	25 %	60650143
20	NC_006873	ACGAA	2	10	1383	1392	60 %	0 %	20 %	20 %	60650143
21	NC_006873	TAT	2	6	1432	1437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650143
22	NC_006873	ATT	2	6	1440	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650143
23	NC_006873	ATC	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650143
24	NC_006873	A	6	6	1472	1477	100 %	0 %	0 %	0 %	60650143
25	NC_006873	ATG	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650143
26	NC_006873	AGA	3	9	1506	1514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
27	NC_006873	AGC	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650143
28	NC_006873	CAAA	2	8	1573	1580	75 %	0 %	0 %	25 %	60650143
29	NC_006873	AT	3	6	1610	1615	50 %	50 %	0 %	0 %	60650143
30	NC_006873	AAG	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
31	NC_006873	AGAA	2	8	1655	1662	75 %	0 %	25 %	0 %	60650143
32	NC_006873	ATGT	2	8	1663	1670	25 %	50 %	25 %	0 %	60650143
33	NC_006873	TGA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650143
34	NC_006873	GAA	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
35	NC_006873	AGA	2	6	1983	1988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
36	NC_006873	AGA	2	6	2028	2033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
37	NC_006873	TTTA	2	8	2043	2050	25 %	75 %	0 %	0 %	60650143
38	NC_006873	GTA	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650143
39	NC_006873	GAA	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
40	NC_006873	GAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
41	NC_006873	A	6	6	3267	3272	100 %	0 %	0 %	0 %	60650144
42	NC_006873	A	7	7	3323	3329	100 %	0 %	0 %	0 %	60650144
43	NC_006873	A	6	6	3340	3345	100 %	0 %	0 %	0 %	60650144
44	NC_006873	TAAA	2	8	3454	3461	75 %	25 %	0 %	0 %	60650144
45	NC_006873	TGA	2	6	3467	3472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650144
46	NC_006873	TCT	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650144
47	NC_006873	GAA	2	6	3497	3502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650144
48	NC_006873	TGA	2	6	3635	3640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650145
49	NC_006873	GT	5	10	3665	3674	0 %	50 %	50 %	0 %	60650145
50	NC_006873	CTG	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60650145
51	NC_006873	GAA	2	6	3787	3792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650145
52	NC_006873	ATAA	2	8	3881	3888	75 %	25 %	0 %	0 %	60650146
53	NC_006873	TCA	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650146
54	NC_006873	GGA	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60650146
55	NC_006873	TCAT	2	8	4073	4080	25 %	50 %	0 %	25 %	60650146
56	NC_006873	GGA	2	6	4090	4095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60650146
57	NC_006873	CTT	2	6	4107	4112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650146
58	NC_006873	ATGA	2	8	4124	4131	50 %	25 %	25 %	0 %	60650146
59	NC_006873	GGT	2	6	4158	4163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60650146
60	NC_006873	ACA	3	9	4202	4210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650147
61	NC_006873	TTA	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650147
62	NC_006873	AT	3	6	4233	4238	50 %	50 %	0 %	0 %	60650147
63	NC_006873	GAA	2	6	4253	4258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650147
64	NC_006873	ACA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650147
65	NC_006873	AAT	2	6	4301	4306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650147
66	NC_006873	ATG	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650147
67	NC_006873	TGA	3	9	4387	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650147
68	NC_006873	AAAG	2	8	4449	4456	75 %	0 %	25 %	0 %	60650148
69	NC_006873	AAT	2	6	4525	4530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650148
70	NC_006873	GAT	2	6	4612	4617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650148
71	NC_006873	ATT	2	6	4624	4629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650148
72	NC_006873	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	60650148
73	NC_006873	GTG	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60650149
74	NC_006873	ATGA	2	8	4796	4803	50 %	25 %	25 %	0 %	60650149
75	NC_006873	ATG	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650149
76	NC_006873	AGG	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60650149
77	NC_006873	GATA	2	8	4825	4832	50 %	25 %	25 %	0 %	60650149
78	NC_006873	ATG	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650149
79	NC_006873	GAA	2	6	4871	4876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650149
80	NC_006873	ACA	2	6	4883	4888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650149
81	NC_006873	TG	3	6	4963	4968	0 %	50 %	50 %	0 %	60650149
82	NC_006873	ATA	2	6	5052	5057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650150
83	NC_006873	ATAG	2	8	5063	5070	50 %	25 %	25 %	0 %	60650150
84	NC_006873	CTTC	2	8	5138	5145	0 %	50 %	0 %	50 %	60650150
85	NC_006873	GAT	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650150
86	NC_006873	GAAA	2	8	5160	5167	75 %	0 %	25 %	0 %	60650150
87	NC_006873	A	6	6	5180	5185	100 %	0 %	0 %	0 %	60650150
88	NC_006873	AGA	2	6	5230	5235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650150
89	NC_006873	ACA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650150
90	NC_006873	ATAA	2	8	5252	5259	75 %	25 %	0 %	0 %	60650150
91	NC_006873	GTT	3	9	5342	5350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650150
92	NC_006873	AATTAT	2	12	5354	5365	50 %	50 %	0 %	0 %	60650150
93	NC_006873	ATT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650150
94	NC_006873	GATA	2	8	5519	5526	50 %	25 %	25 %	0 %	60650150
95	NC_006873	CGA	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650151
96	NC_006873	GGA	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60650152
97	NC_006873	ATA	2	6	5756	5761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650152
98	NC_006873	TA	3	6	5819	5824	50 %	50 %	0 %	0 %	60650152
99	NC_006873	TTC	2	6	5843	5848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650152
100	NC_006873	T	8	8	5856	5863	0 %	100 %	0 %	0 %	60650152
101	NC_006873	A	6	6	5885	5890	100 %	0 %	0 %	0 %	60650152
102	NC_006873	AGA	2	6	5934	5939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650153
103	NC_006873	TTAGAA	2	12	5966	5977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	60650153
104	NC_006873	AAG	2	6	6266	6271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650153
105	NC_006873	AG	3	6	6427	6432	50 %	0 %	50 %	0 %	60650153
106	NC_006873	TA	3	6	6475	6480	50 %	50 %	0 %	0 %	60650153
107	NC_006873	GAAA	2	8	6546	6553	75 %	0 %	25 %	0 %	60650153
108	NC_006873	GGT	2	6	6556	6561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60650153
109	NC_006873	GAT	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650153
110	NC_006873	TTG	2	6	6684	6689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650153
111	NC_006873	TTA	2	6	6755	6760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650153
112	NC_006873	GAAG	2	8	6777	6784	50 %	0 %	50 %	0 %	60650153
113	NC_006873	AGA	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650153
114	NC_006873	CAG	2	6	6862	6867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650153
115	NC_006873	AAT	2	6	6889	6894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650153
116	NC_006873	GCA	2	6	6898	6903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650153
117	NC_006873	TTTA	2	8	6920	6927	25 %	75 %	0 %	0 %	60650153
118	NC_006873	AT	3	6	6933	6938	50 %	50 %	0 %	0 %	60650153
119	NC_006873	AG	3	6	6940	6945	50 %	0 %	50 %	0 %	60650153
120	NC_006873	TTA	2	6	6991	6996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650153
121	NC_006873	AAT	2	6	7020	7025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650153
122	NC_006873	GAA	2	6	7030	7035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650153
123	NC_006873	GAA	2	6	8274	8279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650154
124	NC_006873	CTAA	2	8	8280	8287	50 %	25 %	0 %	25 %	60650154
125	NC_006873	ATGT	2	8	8306	8313	25 %	50 %	25 %	0 %	60650154
126	NC_006873	ATT	2	6	8317	8322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650154
127	NC_006873	AG	3	6	8329	8334	50 %	0 %	50 %	0 %	60650154
128	NC_006873	TTCG	2	8	8377	8384	0 %	50 %	25 %	25 %	60650154
129	NC_006873	TTTG	2	8	8395	8402	0 %	75 %	25 %	0 %	60650154
130	NC_006873	ATA	2	6	8422	8427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650154
131	NC_006873	GAA	2	6	8463	8468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650154
132	NC_006873	AGAAA	2	10	8495	8504	80 %	0 %	20 %	0 %	60650154
133	NC_006873	TCAA	2	8	8562	8569	50 %	25 %	0 %	25 %	60650154
134	NC_006873	ATA	2	6	8570	8575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650154
135	NC_006873	GTA	3	9	9011	9019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
136	NC_006873	CTT	2	6	9036	9041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650155
137	NC_006873	CTT	2	6	9092	9097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650155
138	NC_006873	GAA	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650155
139	NC_006873	TA	3	6	9146	9151	50 %	50 %	0 %	0 %	60650155
140	NC_006873	TCTG	2	8	9164	9171	0 %	50 %	25 %	25 %	60650155
141	NC_006873	AT	3	6	9271	9276	50 %	50 %	0 %	0 %	60650155
142	NC_006873	AAT	2	6	9296	9301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650155
143	NC_006873	AT	3	6	9311	9316	50 %	50 %	0 %	0 %	60650155
144	NC_006873	AAT	2	6	9335	9340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650155
145	NC_006873	AGA	2	6	9369	9374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650155
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147	NC_006873	AATG	2	8	9436	9443	50 %	25 %	25 %	0 %	60650155
148	NC_006873	ATA	2	6	9468	9473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650155
149	NC_006873	TTTTCT	2	12	9491	9502	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	60650155
150	NC_006873	GCA	2	6	9508	9513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650155
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153	NC_006873	GTG	2	6	9585	9590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60650155
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155	NC_006873	TGA	2	6	9649	9654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
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157	NC_006873	TTTA	2	8	9682	9689	25 %	75 %	0 %	0 %	60650155
158	NC_006873	TGA	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
159	NC_006873	AG	3	6	9822	9827	50 %	0 %	50 %	0 %	60650155
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162	NC_006873	TAAT	2	8	9912	9919	50 %	50 %	0 %	0 %	60650155
163	NC_006873	CTT	2	6	9920	9925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650155
164	NC_006873	AATG	2	8	9997	10004	50 %	25 %	25 %	0 %	60650155
165	NC_006873	TGA	2	6	10024	10029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
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174	NC_006873	TGATA	2	10	10216	10225	40 %	40 %	20 %	0 %	60650155
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256	NC_006873	CAC	2	6	14795	14800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60650160
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259	NC_006873	CTT	2	6	14933	14938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650160
260	NC_006873	ACA	2	6	14962	14967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650160
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263	NC_006873	GTT	2	6	15114	15119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650160
264	NC_006873	AATA	2	8	15232	15239	75 %	25 %	0 %	0 %	60650160
265	NC_006873	ATGGC	2	10	15241	15250	20 %	20 %	40 %	20 %	60650160
266	NC_006873	TTC	2	6	15361	15366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650161
267	NC_006873	TTC	2	6	15391	15396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650161
268	NC_006873	ATT	2	6	15412	15417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650161
269	NC_006873	TTTG	2	8	15420	15427	0 %	75 %	25 %	0 %	60650161
270	NC_006873	AGAT	2	8	15430	15437	50 %	25 %	25 %	0 %	60650161
271	NC_006873	T	6	6	15441	15446	0 %	100 %	0 %	0 %	60650161
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273	NC_006873	AAC	2	6	15576	15581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650162
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277	NC_006873	CTAT	2	8	15724	15731	25 %	50 %	0 %	25 %	60650162
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